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 分类:转录调控数据库

转录调控数据库

dbCoRC:超实用核心转录因子数据库

dbCoRC:超实用核心转录因子数据库
在特定的细胞或组织中,发挥作用的转录因子在调控网络中的地位也是不同的。来自胚胎干细胞和其他细胞模型的研究表明,一小组细胞类型特异性或谱系特异性转录因子(TFs)形成了相互连接的自动调节环,以控制特定细胞类型的转录程序。将某种细胞或者组织中的核心转录因子及其调控回路称之为co...

管理员 2年前 (2021-01-11) 177℃ 0评论 0喜欢

TRRUST:转录因子调控网络专用数据库

TRRUST:转录因子调控网络专用数据库
转录调控网络(TRN)的重建是人类遗传学中的长期挑战。已经开发出许多计算方法来从高通量数据推断人类转录因子(TF)和靶基因之间的调控相互作用,TRRUST是迄今为止,最大的可公开免费获得的人类TF-靶标相互作用的数据库。接下来我们来认识TRRUST吧! TRRUST,全称T...

管理员 2年前 (2021-01-08) 217℃ 0评论 0喜欢

TransmiR:转录因子-miRNA调控专用生信数据库

TransmiR:转录因子-miRNA调控专用生信数据库
miRNA是重要的转录后基因表达调控因子,并在各种生物学过程中发挥关键作用。据报道,miRNA的异常调控与多种疾病的发生和发展有关,包括癌症,心血管疾病等。但是潜在的机制仍然难以明确,部分原因是转录因子(TF)-miRNA调控的数据是比较缺乏。这个时候,TransmiR数据...

管理员 2年前 (2021-01-07) 160℃ 0评论 0喜欢

hTFtarget:一个神奇的人类转录因子生信数据库

hTFtarget:一个神奇的人类转录因子生信数据库
转录因子(TFs)可以通过结合其启动子或增强子的特定DNA序列来调节靶基因的表达。鉴定人中的TF-靶标调控是了解生物学过程(包括发育和发病机制)基础的分子调控机制的基础,而不同条件下的转录因子靶基因的变化对研究该转录因子的调控机制也有重要参考意义。 hTFtarge...

管理员 2年前 (2021-01-05) 230℃ 0评论 1喜欢

JASPAR:转录因子motif生信数据库

JASPAR:转录因子motif生信数据库
motif是一段重复出现在基因序列上的一段片段,通常具有高度重复的碱基序列,是转录因子或者DNA结合蛋白识别并结合的锚定点,就像之前说的,一个DNA结合蛋白可能对应多个motif,motif也会对应多个蛋白,但是大体上结合的信息,通过现在高通量的计算方式,是可以找到规律的,...

管理员 2年前 (2020-12-31) 178℃ 0评论 2喜欢