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 分类:甲基化数据库

甲基化数据库

​SurvivalMeth:甲基化预后分析专用生信数据库

​SurvivalMeth:甲基化预后分析专用生信数据库
今天介绍一个特别的甲基化数据库:SurvivalMeth。SurvivalMeth是一个研究DNA甲基化对预后影响的新型数据库,由哈尔滨医科大学李霞教授团队开发,2020年8月份上线。数据库包含来自TCGA,CCLE和GEO的常用数据,记录了多种DMFEs,包括309,46...

管理员 2年前 (2020-12-24) 178℃ 0评论 3喜欢

DiseaseMeth:人类疾病甲基化生信数据库

DiseaseMeth:人类疾病甲基化生信数据库
导语 DiseaseMeth 是一个专注于人类疾病的异常甲基化数据库,不仅包括多种癌症,同时还包括神经发育和退行性疾病、自身免疫疾病等数据集。其中DNA甲基化芯片包含了这两种常见的illuminaDNA甲基化芯片——27K和450K,以及一些定...

管理员 2年前 (2020-12-23) 149℃ 0评论 0喜欢

MethBank:单细胞甲基化生信数据库

MethBank:单细胞甲基化生信数据库
导语 生命与健康大数据中心(The BIG Data Center)由中国科学院北京基因组研究所于2016年成立。中国科学院北京基因组团队通过研究,建立海量生物组学大数据储存、整合与挖掘分析研究体系,发展组学大数据系统构建、挖掘与分析的新技术、...

管理员 2年前 (2020-12-21) 262℃ 0评论 0喜欢

Pubmeth:癌症相关甲基化生信数据库

Pubmeth:癌症相关甲基化生信数据库
研究过程中,也许有一个问题曾经困扰过你:“该基因是否已经在文献中描述为甲基化且属于哪种癌症类型”。虽然不难回答,但解决此类问题比较耗时,一般通过文本挖掘方法(GoldMine)可以部分解决。即便如此,自动搜索后仍需要进行大量审查工作,因此ir. Maté Ongenaert...

管理员 2年前 (2020-12-21) 156℃ 0评论 0喜欢

MethyCancer:癌症相关甲基化基因生信数据库

MethyCancer:癌症相关甲基化基因生信数据库
导语 癌症被列为所有人类疾病中最致命的杀手之一。研究表观遗传修饰的改变模式,最重要的是是弄清DNA甲基化事件如何调节癌基因激活,肿瘤抑制基因沉默和染色体不稳定性,在肿瘤发生中起关键作用。 人类DNA甲基化与癌症(MethyCan...

管理员 2年前 (2020-12-18) 149℃ 0评论 0喜欢

EWAS Data Hub:DNA甲基化芯片生信数据库

EWAS Data Hub:DNA甲基化芯片生信数据库
导语 表观基因组广泛关联研究(Epigenome-wide Association Study,EWAS),基于全基因组范围寻找组间的表观遗传学标记的差别或特征,能够帮助我们了解表观遗传改变与相关形状变化和调控之间的关系。在过去的十年中,由于...

管理员 2年前 (2020-12-17) 160℃ 0评论 0喜欢

m6A-Atlas:m6A甲基化综合型生信数据库

m6A-Atlas:m6A甲基化综合型生信数据库
导语 m6A是mRNA和lncRNA上最普遍的RNA修饰,也是哺乳动物中最显著的RNA修饰。它在各种生物学过程和疾病发病机理中起关键作用。最近的研究表明,m6A在包括病毒感染,压力,热休克和DNA损伤内部的各种生物过程中起着关键作用,并调节多种...

管理员 2年前 (2020-12-17) 290℃ 0评论 2喜欢

SRAMP:哺乳动物m6A修饰位点生信数据库

SRAMP:哺乳动物m6A修饰位点生信数据库
导语 N 6-甲基腺苷(m 6 A)是转录后甲基化修饰,广泛存在于RNA转录本的腺苷碱基上。这种修饰物参与RNA转录物的降解,亚细胞定位,剪接和局部变化的调节。在哺乳动物转录组中,仅这类基序的一小部分确实被修饰,决定m 6 A修饰位点的其他序列...

管理员 2年前 (2020-12-16) 148℃ 0评论 0喜欢

RMVar:m6A修饰相关甲基化生信数据库

RMVar:m6A修饰相关甲基化生信数据库
m6A是mRNA上最丰富的甲基化修饰,是RNA中腺嘌呤(A)上第6位N原子上的甲基,主要存在于mRNA的CDS区和3‘UTR区,影响mRNA的稳定性,翻译效率,可变剪接和定位等。此外,长非编码RNA以及microRNA等非编码RNA也存在m6A位点。 RMVar...

管理员 2年前 (2020-12-15) 158℃ 0评论 0喜欢