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6.081分TCGA生信分析:综合基因组分析揭示胰腺癌焦亡和铁死亡的预后和免疫学特征,用于精准免疫治疗

生信基础 管理员 75℃ 0评论

题目:Integratively Genomic Analysis Reveals the Prognostic and Immunological Characteristics of Pyroptosis and Ferroptosis in Pancreatic Cancer for Precision Immunotherapy

杂志:Front Cell Dev Biol

日期:2022年2月15日

Doi:10.3389/fcell.2022.826879

6.081分TCGA生信分析:综合基因组分析揭示胰腺癌焦亡和铁死亡的预后和免疫学特征,用于精准免疫治疗插图

 

背景:包括细胞焦亡和铁死亡在内的非凋亡性细胞死亡过程与胰腺腺癌 (PAAD) 的进展和治疗反应有关。然而,细胞焦亡和铁死亡对肿瘤生物学的影响程度仍然不明确,尤其是在以“冷”免疫为特征的 PAAD 中。考虑到不同患者之间的异质性,量化单个肿瘤样本中不同的细胞死亡谱更为实用。

 

方法:研究为癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库中的 PAAD 患者开发了焦亡-铁死亡 (P-F) 评分。高 P-F 评分与主动免疫表型、减少基因组改变和显着延长生存期相关。 TCGA-PAAD、ICGC-PACA-CA 和 E-MTAB-6134 队列进一步证实了 P-F 评分在预测总生存期 (OS) 方面的良好准确性。

 

结果:一个免疫治疗队列(IMvigor210 数据集)已经证实,具有高 P-F 评分的患者在治疗反应和临床益处方面表现出显着优势。通过癌症药物敏感性基因组学(GDSC)分析对化疗药物的敏感性,P-F评分低的患者可能对紫杉醇和5-氟尿嘧啶更敏感。

 

结论:总的来说,基于细胞死亡谱系统评估的 P-F 评分可以作为预测 PAAD 患者对化疗药物或免疫疗法治疗的结果和反应的有效生物标志物。

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