生信学习,咨询,代做,请关注公众号:生信风暴。或添加客服微信:ShengxinBoss1

3.111分TCGA生信分析:LINC00628在肺腺癌和鳞状细胞癌之间差异表达,并与NSCLC的预后相关

生信基础 管理员 109℃ 0评论

题目:LINC00628 is differentially expressed between lung adenocarcinoma and squamous cell carcinoma and is associated with the prognosis of NSCLC

杂志:Oncol Lett

日期:2022年2月

Doi:10.3892/ol.2021.13173

3.111分TCGA生信分析:LINC00628在肺腺癌和鳞状细胞癌之间差异表达,并与NSCLC的预后相关插图

 

背景:非小细胞肺癌 (NSCLC) 仍然是全球最常见的恶性肿瘤,肺腺癌 (LUAD) 和肺鳞状细胞癌 (LUSC) 代表两种主要亚型。 LINC00628 已被证明可促进 LUAD 进展,然而,其在 NSCLC 中的临床作用仍然难以捉摸。

 

方法:研究的目的是分析长基因间非蛋白编码 RNA 628 (LINC00628) 在 NSCLC 中的表达,包括在 LUAD 和 LUSC 亚型中的表达。此外,还检查了其在 NSCLC 发展和预后中的作用。来自癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库的数据首先用于评估 LUAD 和 LUSC 中的表达和预后潜力,然后使用逆转录定量 PCR 测量 128 个 NSCLC 组织中的 LINC00628 表达。ROC曲线用于评估 LINC00628 区分 LUAD 和 LUSC 患者的能力。 Kaplan-Meier曲线用于分析LINC00628表达与患者总生存期的关系。 Cox 回归分析用于探索可能与 NSCLC 总生存期独立相关的潜在预后因素。

 

结果:与匹配的正常对照相比,LINC00628 在 NSCLC 组织中的表达显着上调(P<0.001)。 LUAD 病例中的 LINC00628 表达水平也显着高于 LUSC 患者(P<0.001)。此外,LINC00628 可以区分 LUAD 和 LUSC 病例。 LINC00628的表达与肿瘤大小(P=0.013)、组织学类型(P=0.009)、淋巴结转移(P=0.021)和TNM分期(P=0.008)显着相关。基于 TCGA 和本研究中包括的患者的数据进行的生存分析确定了 LINC00628 与 LUAD 的总体生存率之间存在关联,但在 LUSC 中未观察到这种关系的 TCGA 数据。 Cox 回归生信分析表明,LINC00628 的高表达与 LUAD 患者的总生存期差有关(P=0.001),但与 LUSC 患者无关(P=0.088)。

 

结论:总之,LINC00628 表达在 NSCLC 中上调并与患者预后相关。 LUAD 患者的 LINC00628 表达水平高于 LUSC 患者,增加的 LINC00628 是 LUAD 的独立预后因素,但不是 LUSC。

转载请注明:智汇基因 » 3.111分TCGA生信分析:LINC00628在肺腺癌和鳞状细胞癌之间差异表达,并与NSCLC的预后相关

喜欢 (1)
发表我的评论
取消评论
表情

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址