生信学习,咨询,代做,请关注公众号:生信风暴。或添加客服微信:ShengxinBoss1

3.784分TCGA生信分析:一种新的细胞焦亡相关基因风险预测模型,用于子宫内膜癌的预后和免疫治疗反应

生信基础 管理员 73℃ 0评论

题目:A novel risk prediction model of pyroptosis-related genes for the prognosis and immunotherapy response of endometrial cancer

杂志:Eur Rev Med Pharmacol Sci

日期:2022年4月

Doi:10.26355/eurrev_202204_28456

3.784分TCGA生信分析:一种新的细胞焦亡相关基因风险预测模型,用于子宫内膜癌的预后和免疫治疗反应插图

目的:本研究旨在建立一个基于细胞焦亡相关基因对子宫内膜癌(UCEC)免疫治疗敏感性的影响的风险预测模型,UCEC 是最常见和最具威胁性的妇科恶性肿瘤之一。

 

患者和方法:通过多重生物信息学分析,我们从癌症基因组图谱 (TCGA) 和基因表达谱交互分析 (GEPIA) 中获得了与 UCEC 相关的 RNA 测序数据的原始计数和相应的临床信息,以研究差异表达的潜在机制焦亡相关基因(DEPRGs),包括DEPRGs与预后、肿瘤免疫微环境和UCEC患者免疫治疗敏感性的相关性。基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析用于找出功能差异。此外,构建了一个 mRNA-miRNA-lncRNA 网络来识别细胞焦亡对肿瘤进展的潜在影响。

 

结果:在这项研究中,我们实现了六个 DEPRG(CASP3、GPX4、GSDMD、NOD2、PYCARD 和 TIRAP)并构建了一个 6 基因特征,将 TCGA 队列中的 UCEC 患者分为低风险组或高风险组.低风险组患者的生存时间显着延长(p=0.000373)。结合临床特征,风险评分也被证实为独立的预后因素。 GO和KEGG功能分析揭示了六种DEPRGs影响UCEC患者抗肿瘤免疫的可能分子机制。此外,我们发现两个 DEPRGs (GPX4, TIRAP) 不仅与肿瘤突变负荷 (TMB) 或微卫星不稳定性 (MSI) 显着相关,而且还参与调节 CD8+ 细胞的数量和功能。

 

结论:综合生物信息学分析得出结论,细胞焦亡相关基因(PRGs)可以预测EC患者的预后,并在调节EC患者的抗肿瘤免疫反应中发挥作用。

转载请注明:智汇基因 » 3.784分TCGA生信分析:一种新的细胞焦亡相关基因风险预测模型,用于子宫内膜癌的预后和免疫治疗反应

喜欢 (0)
发表我的评论
取消评论
表情

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址