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2.16分TCGA生信分析:综合分析 SLC7A 家族成员在乳腺癌中的诊断和预后价值

生信基础 管理员 74℃ 0评论

题目:A comprehensive analysis of the diagnostic and prognostic value associated with the SLC7A family members in breast cancer

杂志:Gland Surg

日期:2022年2月

Doi:10.21037/gs-21-909

2.16分TCGA生信分析:综合分析 SLC7A 家族成员在乳腺癌中的诊断和预后价值插图

 

背景:溶质载体 (SLC) 7 家族基因作为葡萄糖和谷氨酸转运蛋白在癌细胞代谢中发挥核心作用。然而,它们在乳腺癌 (BC) 中的表达和预后价值仍有待阐明。

 

方法:从癌症基因组图谱 (TCGA) 和 Kaplan-Meier (KM) 生信分析数据库下载 BC 患者的临床数据。使用 Cox 回归和对数秩检验探索了 SLC7A 表达与总生存期 (OS) 之间关联的机制。 ESTIMATE 给出了免疫细胞浸润的量度。进行单样本 (ss) 基因集富集生信分析 (GSEA) 以量化免疫细胞浸润。

 

结果:根据 TCGA 和 KM 生信分析数据,高 SLC7A5 表达与 BC 患者较差的生存时间相关。根据 TCGA 数据,SLC7A4 与良好的无进展间期 (PFI) 和疾病特异性生存期 (DSS) 相关。此外,根据 KM 绘图仪数据,SLC7A4 与 OS 的良好预后、无远处转移生存期 (DMFS)、无复发生存期 (RFS) 和进展后生存期 (PPS) 相关。在 TCGA 数据中,SLC7A3 表达与 OS 呈正相关,但与 PFI 或 DSS 没有强相关性。然而,在 KM 数据库分析中,SLC7A3 与 DMFS 和 RFS 呈正相关。 SLC7A 在 BC 患者中具有极好的诊断价值,并且与肿瘤浸润密切相关。 T 辅助 2 (Th2) 细胞、CD56 明亮自然杀伤 (NK) 细胞和 NK 细胞与 SLC7A 家族基因的相关性最强,这表明这些基因在 BC 中发挥关键作用,部分是通过调节免疫浸润。

 

结论:SLC7A4 和 SLC7A5 表达水平可能是预测 BC 结局的敏感生物标志物。 SLC7A3 可能是 BC 中潜在的诊断和预后生物标志物,但需要进一步的研究来验证这些结果。

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