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3.111分TCGA生信分析:lncRNA BBOX1-AS1对肺鳞癌增殖迁移的临床意义及影响

生信基础 管理员 167℃ 0评论

题目:Clinical significance and effect of lncRNA BBOX1-AS1 on the proliferation and migration of lung squamous cell carcinoma

杂志:Oncol Lett

日期:2022年1月

Doi:10.3892/ol.2021.13135

3.111分TCGA生信分析:lncRNA BBOX1-AS1对肺鳞癌增殖迁移的临床意义及影响插图

 

背景:长链非编码 RNA (lncRNA) 在肺鳞状细胞癌 (LUSC) 的发生和发展中发挥作用。 BBOX1-AS1可能有助于疾病的发展。然而,迄今为止还没有关于 BBOX1-AS1 在 LUSC 中作用的研究。

 

方法:进行了内部基因微阵列分析,以检测三对 LUSC 和正常肺组织之间差异表达的 lncRNA 和 mRNA。只有一个 lncRNA,BBOX1-AS1,在内部微阵列和癌症基因组图谱 (TCGA)、基因表达综合 (GEO) 和 ArrayExpress 数据库中差异表达。然后进行逆转录定量 PCR (RT-qPCR),并使用来自 TCGA、GEO 和 ArrayExpress 数据集的原始 RNA 测序数据来确定 BBOX1-AS1 在 LUSC 中的表达和临床价值。此外,还进行了细胞计数试剂盒8测定、细胞周期分析和划痕测定,以探索BBOX1-AS1表达是否影响体外LUSC细胞的增殖和迁移。

 

结果:RT-qPCR 分析结果和从 TCGA 数据库、GEO 数据集、内部基因微阵列和标准平均偏差分析获得的数据都支持 BBOX1-AS1 在 LUSC 中的上调表达水平。此外,根据体外试验,BBOX1-AS1 的沉默抑制了 LUSC 细胞的增殖和迁移。在敲低 BBOX1-AS1 后,细胞在 S 期停滞。

 

结论:总之,BBOX1-AS1 的表达水平在 LUSC 组织中上调。 BBOX1-AS1 可能通过调节各种生物学功能对 LUSC 发挥致癌作用。然而,应该进行额外的功能实验来验证确切的机制。

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