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3.26分TCGA生信分析:糖酵解相关基因特征的构建和验证,用于预测低级别胶质瘤的总体存活率

生信基础 管理员 110℃ 0评论

题目:Construction and Verification of a Glycolysis-Associated Gene Signature for the Prediction of Overall Survival in Low Grade Glioma

杂志:Front Genet

日期:2022年3月23日

Doi:10.3389/fgene.2022.865472

3.26分TCGA生信分析:糖酵解相关基因特征的构建和验证,用于预测低级别胶质瘤的总体存活率插图

 

背景:可能发展为高级别恶性胶质瘤的低级别胶质瘤 (LGG) 患者的总生存期显示出明显的异质性。目前使用的临床评价指标不足以准确预测准确的预后结果。为了优化 LGG 患者的生存风险分层和个性化管理,迫切需要开发准确的风险预测模型。

 

方法:从癌症基因组图谱(TCGA)生信分析数据库下载的 TCGA-LGG 数据集用作训练队列,中国胶质瘤基因组图谱(CGGA)数据集和伦勃朗数据集用作验证队列。对各种癌症标志物的水平进行了量化,将糖酵解确定为 LGG 中主要的总体生存相关风险因素。此外,使用各种生物信息学和统计方法,开发了一种强大的糖酵解相关基因特征来预测预后。

 

结果:基因集富集分析表明,高危神经胶质瘤与放化疗耐药和生存率低相关。此外,基于已建立的风险模型和其他临床特征,构建了决策图和列线图,可作为 LGG 诊断和治疗的有用工具。

 

结论:该研究表明,糖酵解相关基因特征可以精确区分高危和低危患者,因此可以作为独立的临床特征。

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