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6.684分TCGA生信分析:用于预测肉瘤患者总体生存率和免疫治疗效果的补体相关基因标记

生信基础 管理员 458℃ 0评论

题目:A Complement-Related Gene Signature for Predicting Overall Survival and Immunotherapy Efficacy in Sarcoma Patients

杂志:Front Cell Dev Biol

日期:2022年4月14日

Doi:10.3389/fcell.2022.765062

6.684分TCGA生信分析:用于预测肉瘤患者总体生存率和免疫治疗效果的补体相关基因标记插图

 

背景:肉瘤的预后较差,对系统治疗的反应有限且有争议。因此,迫切需要对风险因素进行分层,并确定哪些患者可能受益于系统治疗。

 

方法:开发了一种可靠的、基于补体的基因标记来预测肉瘤患者的预后。生存相关补体基因通过单变量Cox分析确定,并用于构建基因特征,进一步使用Lasso生信分析,并使用逐步Cox比例风险回归模型确定。TCGA的整个肉瘤队列被随机分为训练集和测试集。

 

结果:使用训练集构建特征码,随后在测试集、整个TCGA肉瘤队列以及分别来自目标和GEO数据库的另外两个独立队列中进行验证。此外,在一个独立队列中也验证了该特征的预后价值。该模型有效地预测了整个训练集、不同验证队列和不同临床亚组的预后。接下来,进行免疫细胞浸润分析、GO和KEGG生信分析以及基因集富集分析,以探索该特征的可能潜在机制。此外,该特征可能预测免疫治疗的反应。

 

结论:当前补体相关基因特征可以预测肉瘤患者的总体生存率和可能的免疫治疗反应,它可能成为进一步优化肉瘤患者临床治疗和预后管理的有力预后工具。

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