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2.718分TCGA生信分析:用于预测直肠癌预后和免疫微环境的新型低氧评分的开发和验证

生信基础 管理员 80℃ 0评论

题目:Development and Validation of a Novel Hypoxia Score for Predicting Prognosis and Immune Microenvironment in Rectal Cancer

杂志:Front Surg

日期:2022年4月25日

Doi:10.3389/fsurg.2022.881554

2.718分TCGA生信分析:用于预测直肠癌预后和免疫微环境的新型低氧评分的开发和验证插图

 

背景:低氧在各种肿瘤类型中起主要作用,然而,很少有研究集中在直肠癌缺氧相关基因的预后模型以及缺氧对中性粒细胞介导的免疫抑制的影响。

 

方法:对342个缺氧相关基因进行了Kaplan-Meier生信分析、随机生存分析和Cox回归分析,在基因表达综合(GEO)队列中构建了缺氧评分,并在癌症基因组图谱(TCGA)队列中进行了验证。然后根据危险程度将患者分为两组。高风险组的总生存率显著高于低风险组。通过决策曲线分析,基于缺氧评分的诺模图具有良好的预测能力。

 

结果:功能富集分析表明,缺氧、转移、炎症、免疫等相关途径得到富集。HRisk组肿瘤纯度较低,免疫和基质评分较高,中性粒细胞较高,活化记忆CD4+T细胞较低。更重要的是,HRisk组中性粒细胞介导的免疫抑制检查点增加。

 

结论:总之,基于5个低氧相关基因的低氧评分可用于预测直肠癌的预后,具有抑癌作用的ANLN和具有促癌作用的SRPX可能是直肠癌的潜在治疗靶点。

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