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4.599分生信分析:脑胶质瘤微环境中CXCR成员的预后价值和治疗前景

生信基础 管理员 166℃ 0评论

题目:Prognostic Value and Therapeutic Perspectives of CXCR Members in the Glioma Microenvironment

日期:2022年4月8日

杂志:Front Gene

Doi: 10.3389/fgene.2022.787141

4.599分生信分析:脑胶质瘤微环境中CXCR成员的预后价值和治疗前景插图

 

背景:CXCR(CXC趋化因子受体)是一种免疫相关蛋白复合体,通过肿瘤微环境(TME)中的各种化学信号参与肿瘤激活、侵袭、迁移和血管生成。然而,CXCR成员的重要预后特征及其对胶质瘤发生和发展的影响尚未完全阐明。

方法:在本研究中,使用Oncomine、TCGA、GTEx和CGGA生信分析数据库分析胶质瘤患者的转录和生存数据。随后,利用综合生信分析探讨了CXCR成员对TME的影响。

结果:脑胶质瘤中CXCR1/2/3/4/7的mRNA表达水平显著高于正常对照组,而CXCR5的mRNA表达水平显著降低。然后,总结了CXCR的遗传改变情况,并根据CXCR在胶质瘤中的表达模式确定了两个分子亚型。还研究了CXCR的特征,包括临床病理参数、TME细胞浸润和胶质瘤患者的预后。在Lasso和多变量Cox回归生信分析后,构建了预测总生存率(OS)的CR评分,并验证了特征码的预测性能。根据CR评分判断,高危组的预后明显低于低风险组(TCGA队列,p<0.001,CGGA队列,p<0.001)。此外,CR评分与肿瘤免疫浸润和肿瘤干细胞(CSC)指数显著相关。由此建立了一个基于风险量表的诺模图,纳入了临床因素,用于个体风险估计。

结论:这些发现可能为加深对CXCR修饰模式的理解和开发更好的胶质瘤免疫治疗方法铺平道路。

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