生信学习,咨询,代做,请关注公众号:生信风暴。或添加客服微信:ShengxinBoss1

3.399分TCGA生信分析:肿瘤浸润性肥大细胞密度低对宫颈癌预后有利

生信基础 管理员 184℃ 0评论

题目:Low Tumor Infiltrating Mast Cell Density Reveals Prognostic Benefit in Cervical Carcinoma

杂志:Technol Cancer Res Treat

日期:2022年1月

Doi:10.1177/15330338221106530

3.399分TCGA生信分析:肿瘤浸润性肥大细胞密度低对宫颈癌预后有利插图

 

目的:对肥大细胞在宫颈肿瘤免疫中作用的研究较为有限。因此,研究旨在评估子宫颈癌的预后价值及其与宫颈癌免疫微环境的相关性。

方法:利用TCGA生信分析数据获得CC中MCs的免疫浸润程度。同时,研究回顾性收集患者临床特征资料和组织标本,进一步验证相关结论。在TCGA数据中采用CIBERSORT算法测量肥大细胞密度(MCD),并对CC组织中的类胰蛋白酶进行免疫组织化学染色。最后,使用“limma”软件包执行TCGA数据的差异表达基因(DEG),并使用Cytoscape中的MCODE应用程序识别关键基因模块。

结果:MCs广泛分布于CC组织中。此外,发现低肿瘤浸润性MCD有利于TCGA队列的总体生存率(OS)。在临床队列中也得到了一致的结论。此外,在高肿瘤浸润性MCD组和低肿瘤浸润性MCD组之间共分析305个DEG。通过MCODE插件筛选出7个关键模块,共34个基因,主要与炎症反应和免疫反应有关,与细胞因子密切相关,包括CSF2、CCL20、IL1A、IL1B和CXCL8。

结论:总之,CC组织中高肿瘤浸润的MCs与患者的OS恶化相关,MCs与肿瘤微环境中的细胞因子密切相关,表明它们共同在肿瘤的免疫反应中发挥作用,因此,MCD可能是CC潜在的预后指标和免疫治疗靶点。

转载请注明:智汇基因 » 3.399分TCGA生信分析:肿瘤浸润性肥大细胞密度低对宫颈癌预后有利

喜欢 (2)
发表我的评论
取消评论
表情

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址