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6.244分TCGA生信分析:识别乳酸相关基因标记预测皮肤黑色素瘤的进展和免疫治疗反应

生信基础 管理员 168℃ 0评论

题目:Identification of Lactate-Related Gene Signature for Prediction of Progression and Immunotherapeutic Response in Skin Cutaneous Melanoma

杂志:Front Oncol

日期:2022年5月30日

Doi:10.3389/fonc.2022.818868

6.244分TCGA生信分析:识别乳酸相关基因标记预测皮肤黑色素瘤的进展和免疫治疗反应插图

 

背景:皮肤黑色素瘤是一种以高度免疫细胞浸润为特征的皮肤癌。乳酸是SKCM肿瘤微环境(TME)中的主要代谢产物,其潜在功能尚不清楚。

方法:研究系统分析了乳酸相关基因(LRG)对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中SKCM患者的预后和对免疫检查点抑制剂(ICI)的反应的预测价值。

结果:通过对61个LRG的一致聚类,第3组表现出更差的临床结果,归因于恶性标志物的过度表达。此外,研究为高风险和低风险患者创建了一个预后预测模型,并在验证队列GSE65904中验证了其性能。在TME和风险模型之间,发现免疫细胞浸润水平与患者的风险评分呈负相关。与高危病例相比,低风险病例具有更高的ICI表达,并且可以更好地受益于ICI。

结论:乳酸相关的预后风险特征可能为SKCM免疫治疗的未来研究提供全面的基础。

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