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4.599分TCGA生信分析:细胞外基质标志物作为肺腺癌新的潜在预后生物标志物的鉴定

生信基础 管理员 334℃ 0评论

题目:Identification of Extracellular Matrix Signatures as Novel Potential Prognostic Biomarkers in Lung Adenocarcinoma

杂志:Front Genet

日期:2022年5月30日

Doi:10.3389/fgene.2022.872380

4.599分TCGA生信分析:细胞外基质标志物作为肺腺癌新的潜在预后生物标志物的鉴定插图

 

背景:细胞外基质(ECM)对正常细胞功能至关重要,已成为癌症发生和转移的关键因素。然而,ECM组织相关基因在肺腺癌(LUAD)患者中的预后和肿瘤学价值尚未全面探讨。

方法:在研究中,包括来自癌症基因组图谱(TCGA,训练集)和其他三个验证集(GSE87340、GSE140343和GSE115002)的LUAD样本,然后基于ECM组织相关基因构建了一个三基因预后特征。涉及COL4A6、FGA和FSCN1的预后特征在训练和验证数据集中都是强大和稳健的。

结果:进一步构建了一个综合预后诺模图,通过整合ECM组织相关特征与临床特征(包括年龄和TNM分期)来促进临床实践。风险评分较高的患者具有增殖、转移和免疫特征。值得注意的是,高危组肿瘤组织中的成纤维细胞浸润率较高。因此,据报道由癌症相关成纤维细胞(CAF)分泌的因子(IGFBP5、CLCF1和IL6)在高危组中表现出较高的表达水平。

结论:研究结果强调了细胞外基质组织特征在LUAD中的预后价值,并深入了解了细胞外基质组织相关特征的具体临床和分子特征,这可能对患者治疗很重要。

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