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5.246分TCGA生信分析:肺鳞状细胞癌双基因免疫基因组相关预后标志的构建

生信基础 管理员 114℃ 0评论

题目:Construction of a Two-Gene Immunogenomic-Related Prognostic Signature in Lung Squamous Cell Carcinoma

杂志:Front Mol Biosci

日期:2022年4月8日

Doi:10.3389/fmolb.2022.867494

5.246分TCGA生信分析:肺鳞状细胞癌双基因免疫基因组相关预后标志的构建插图

 

背景:肺癌是中国肿瘤发病率最高的疾病。肺鳞状细胞癌(LUSC)是最常见的类型,占原发性肺癌的40-51%。LUSC生长缓慢,转移较晚。免疫相关基因(IRG)和免疫浸润细胞在LUSC的临床结果中起着至关重要的作用。系统研究其免疫基因图谱对癌症患者的预后有重要意义。

 

方法:在研究中,研究结合从TCGA和InnatedDB数据库下载的IRG的预后情况和表达状态,系统分析LUSC患者的预后信息以获得IRG。

 

结果:在对生存分析进行系统探索后,发现了与预后相关的基因,PPI网络显示共有11个基因为hub基因。通过多变量Cox分析建立了双基因预后风险模型。两种IRG与LUSC的预后密切相关。基于这两个基因,建立了一个新的独立预后风险模型,并在GEO数据库中进一步验证了该模型。此外,该模型的风险评分与LUSC患者的性别、生存状态和淋巴转移相关,预后风险模型的预测风险与五种免疫细胞(CD4 T细胞、CD8 T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞)显著正相关。

 

结论:研究综合分析了免疫组学,并提出了LUSC的免疫相关预后生物标志物。

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