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4.06分TCGA生信分析:肝细胞癌中C10orf91和LINC01224的高表达与预后不良

生信基础 管理员 286℃ 0评论

题目:High expression of C10orf91 and LINC01224 in hepatocellular carcinoma and poor prognosis

杂志:Am J Transl Res

日期:2022年4月15日

4.06分TCGA生信分析:肝细胞癌中C10orf91和LINC01224的高表达与预后不良插图

 

背景:长非编码RNA(lncRNAs)的失调在包括肝脏疾病在内的许多人类疾病的发病机制中起着重要作用。一些lncRNAs与肝细胞癌(HCC)的进展相关,但其作为肝癌诊断标志物的功能仍有待确定。

目的:本研究旨在确定肝癌的潜在诊断标志物。

方法:利用肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库获取肝癌基因转录组数据。此外,研究纳入了义乌市中心医院收治的70名肝癌患者和50名健康人,他们在2017年2月至2020年1月期间同时接受了体检。采用定量逆转录聚合酶链反应(qRT PCR)检测患者组织和血清中C10orf91和LINC01224的表达。随访5年进行生存观察。通过miRNA靶点预测在线数据库预测C10orf91和LINC01224的潜在和靶向miR。进行了基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,绘制了竞争性内源性RNA(ceRNA)网络图。

结果:共筛选出175个差异表达的lncRNAs,其中上调173个,下调2个。C10orf91和LINC01224是肝癌的独立预后因素(P<0.05)。C10orf91和LINC01224对鉴别肝癌、肿瘤淋巴结转移(TNM)分期和淋巴结转移有诊断价值。GO和KEGG富集分析表明,C10orf91和LINC01224分别参与23种重要的生物学功能和35种重要的信号转导途径。

结论:C10orf91和LINC01224在预后不良的肝癌患者中高表达。

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