生信学习,咨询,代做,请关注公众号:生信风暴。或添加客服微信:ShengxinBoss1

6.244分TCGA生信分析:ADAMTS12的综合泛癌分析及其在胰腺癌中的潜在意义

生信基础 管理员 435℃ 0评论

题目:An Integrated Pan-Cancer Analysis of ADAMTS12 and Its Potential Implications in Pancreatic Adenocarcinoma

杂志:Front Oncol

日期:2022年2月23日

Doi:10.3389/fonc.2022.849717

6.244分TCGA生信分析:ADAMTS12的综合泛癌分析及其在胰腺癌中的潜在意义插图

背景:具有血小板反应蛋白1型基序12的去整合素和金属肽酶(ADAMTS12)是ADAMTS家族的多域胞外蛋白酶,参与许多肿瘤的进展。然而,尚未对该基因进行泛癌分析。其在胰腺癌(PAAD)中的作用也尚不清楚。

方法:利用肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因型组织表达数据(GTEx)数据库分析ADAMTS12在泛癌组织中的表达。研究评估了ADAMTS12的表达、临床特征、预后意义、拷贝数改变、甲基化和突变及其与肿瘤免疫微环境的相关性。还进行了qRT PCR和免疫组织化学分析,以验证ADAMTS12在PAAD中的表达。

结果:通过生物信息学分析和初步实验验证,发现ADAMTS12在PAAD中大量过度表达。ADAMTS12的高表达水平与PAAD患者的较差生存率以及肿瘤相关巨噬细胞、肿瘤相关成纤维细胞、免疫检查点蛋白和免疫抑制基因的高浸润水平相关。

结论:研究结果表明ADAMTS12是PAAD潜在的预后生物标志物,ADAMTS12表达升高也可能表明存在免疫抑制微环境。

 

 

 

 

 

转载请注明:智汇基因 » 6.244分TCGA生信分析:ADAMTS12的综合泛癌分析及其在胰腺癌中的潜在意义

喜欢 (0)
发表我的评论
取消评论
表情

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址