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4+TCGA生信分析:将 miRNA 鉴定为药物特异性生存生物标志物

生信基础 管理员 121℃ 0评论

题目:Integrative analysis of TCGA data identifies miRNAs as drug-specific survival biomarkers

杂志:Sci Rep

日期:2022 年 4 月 26 日

Doi:10.1038/s41598-022-10662-6

 

预测药物特异性结果的生物标志物是个性化医疗的重要工具。在这项研究中,我们提出了一项综合分析,以鉴定可预测癌症中药物特异性生存结果的 miRNA。使用来自 TCGA 的临床数据,我们定义了患有相同癌症并接受相同药物治疗的癌症患者的子集,我们称之为癌症药物组。然后,我们使用 TCGA 中的 miRNA 表达数据来评估每个 miRNA 预测每个癌症药物组患者生存结果的能力。因此,鉴定出的 miRNA 以癌症特异性和药物特异性方式预测生存结果。尤其,大多数药物特异性 miRNA 生存标志物及其靶基因在表达相关性和生存相关性方面表现出一致性。在各种癌症的背景下,一些已鉴定的 miRNA 得到了已发表文献的支持。我们探索了几个额外的提供 miRNA 表达和生存数据的乳腺癌数据集,并表明我们的乳腺癌药物特异性 miRNA 生存标志物能够有效地对这些额外数据集中的患者预后进行分层。总之,这项分析揭示了癌症生存的药物特异性 miRNA 标志物,这可能是个性化医疗的有希望的工具。我们探索了几个额外的提供 miRNA 表达和生存数据的乳腺癌数据集,并表明我们的乳腺癌药物特异性 miRNA 生存标志物能够有效地对这些额外数据集中的患者预后进行分层。总之,这项分析揭示了癌症生存的药物特异性 miRNA 标志物,这可能是个性化医疗的有希望的工具。我们探索了几个额外的提供 miRNA 表达和生存数据的乳腺癌数据集,并表明我们的乳腺癌药物特异性 miRNA 生存标志物能够有效地对这些额外数据集中的患者预后进行分层。总之,这项分析揭示了癌症生存的药物特异性 miRNA 标志物,这可能是个性化医疗的有希望的工具。

这项研究表明,miRNA 可以成为预测癌症中药物特异性生存结果的有效生物标志物。我们确定的 miRNA 标记很有前景,可能是个性化医疗的有用工具。

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