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3.9分TCGA生信分析:宫颈癌代谢重编程的预测研究

生信基础 管理员 226℃ 0评论

题目:A predictive study of metabolism reprogramming in cervical carcinoma

杂志:Ann Transl Med

日期:2022 年 4 月

Doi:10.21037/atm-22-981

3.9分TCGA生信分析:宫颈癌代谢重编程的预测研究插图

背景: 代谢重编程已被确定为癌症的标志,影响肿瘤微环境中的免疫。由于宫颈癌的高异质性,我们的目标是找出宫颈癌的代谢亚型来指示预后。

方法: 我们使用从癌症基因组图谱 (TCGA) 和基因表达综合 (GEO) 数据集获得的转录组数据分析了不同的代谢特征。进行生物信息学分析以确定总生存期和化疗耐药性的可能生物标志物。

结果: 免疫浸润与代谢途径密切相关,尤其是碳水化合物途径和脂质与能量途径。鉴定了两个不同的差异表达基因簇。选择 6 个基因作为可能的预后指标,包括ELK3BIN2MEI1CCR7CYP4F12DUOX1 ,与肿瘤微环境的免疫状态有关。在基于代谢基因的风险评分模型下,高危组的生存率显着降低(HR=6.802,95% CI:3.637-12.721,P<0.0001),化疗耐药的可能性更高,抗-肿瘤免疫细胞与低风险组相比。

结论: 代谢重编程,尤其是碳水化合物途径和脂质和能量代谢途径,与免疫细胞微环境相关,对侵袭性宫颈癌(ICC)的预后至关重要,为临床提供潜在的治疗靶点。

代谢重编程是介导恶性转化事件的重要途径,因此它在 ICC 的预后中起着至关重要的作用。目前的这项研究表明,免疫浸润亚型与代谢途径密切相关,尤其是碳水化合物途径,以及脂质和能量代谢途径。此外,EMT 评分证明了代谢重编程、TME 和 EMT 之间的关系。不同免疫亚型之间的HPV类型、病理M状态和病理N状态也存在显着差异,提示TME同时受到宫颈癌和HPV感染的影响。

我们的研究发现了代谢重编程超越 Warburg 效应对癌细胞及其微环境的联系,为调节 TME 免疫提供了潜在的代谢途径关键基因,但仍需要进行更多的分子和细胞检查来探索ICC代谢物调节TME免疫的具体机制。

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