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6+TCGA生信分析:ASF1B 通过影响肝细胞癌的细胞周期和增殖作为潜在的治疗靶点

生信基础 管理员 143℃ 0评论

题目:ASF1B Serves as a Potential Therapeutic Target by Influencing Cell Cycle and Proliferation in Hepatocellular Carcinoma

杂志:Front Oncol

日期:2022 年 1 月 11 日

Doi: 10.3389/fonc.2021.801506. eCollection 2021

6+TCGA生信分析:ASF1B 通过影响肝细胞癌的细胞周期和增殖作为潜在的治疗靶点插图

 

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性肿瘤之一,具有较高的发病率和死亡率。因此,寻找能够有效预测HCC预后和进展的潜在生物标志物非常重要。最近的研究表明,抗沉默功能1B(ASF1B)可能是肿瘤诊断和预后的新增殖标志物。然而,ASF1B 在肝细胞癌中的表达和功能仍有待确定。在这项研究中,癌症基因组图谱 (TCGA)、基因型组织表达 (GTEx) 和基因表达综合 (GEO) 数据库的综合分析表明 ASF1B 在 HCC 中高表达。Kaplan-Meier 生存曲线显示,ASF1B 表达升高与肝癌患者的低生存率相关。免疫浸润的相关性分析表明 ASF1B 的表达与 HCC 患者的免疫细胞浸润显着相关。基因集富集分析 (GSEA) 表明 ASF1B 调节细胞周期、DNA 复制和卵母细胞减数分裂信号。我们的实验证实 ASF1B 在 HCC 组织和 HCC 细胞系中高表达。ASF1B的沉默抑制了肝细胞癌细胞的生长体外。此外,ASF1B 缺乏诱导细胞凋亡和细胞周期停滞。从机制上讲,ASF1B 敲低降低了增殖细胞核抗原 (PCNA)、cyclinB1、cyclinE2 和 CDK9 的表达。此外,ASF1B 与 HCC 细胞中的 CDK9 相互作用。总之,这些结果表明致癌基因 ASF1B 可能是抑制肝细胞癌细胞生长的靶标。

在这项研究中,我们在癌症基因组图谱 (TCGA) 和各种公共数据库中调查了 ASF1B 在 HCC 患者中的表达和预后。此外,我们分析了 ASF1B 的共表达基因,以探索 ASF1B 在 HCC 中的潜在机制。进行实验以验证 ASF1B 在 HCC 组织和细胞系中的表达。诱导HCC细胞系中的ASF1B敲低以检测体外生物学行为变化。我们的数据暗示 ASF1B 与 HCC 细胞的增殖和迁移密切相关,可能是 HCC 患者的新预后指标和治疗靶点。

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