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7+TCGA生信分析:胃癌血管生成相关基因的分子特征、临床意义和癌症免疫相互作用

生信基础 管理员 334℃ 0评论

题目:Molecular Characteristics, Clinical Significance, and Cancer Immune Interactions of Angiogenesis-Associated Genes in Gastric Cancer

杂志:Front Immunol

日期:2022 年 2 月 22 日

Doi: 10.3389/fimmu.2022.843077. eCollection 2022

 

背景: 免疫疗法已发展成为治疗多种癌症的关键选择。对免疫疗法的积极反应依赖于癌症与肿瘤微环境 (TME) 之间的独特相互作用。血管生成是癌症的标志之一。然而,在胃癌 (GC) 中,血管生成与临床结果、免疫细胞浸润和免疫治疗之间的关联仍然未知。

方法: 我们系统地评估了 36 个血管生成相关基因 (AAG),并全面确定了血管生成与转录模式、预后和免疫细胞浸润之间的相关性。AAG_score 用于量化每个患者的血管生成亚型。然后,我们评估了它们在 GC 预后预测和治疗反应中的价值。

结果: 我们从遗传水平讨论了 GC 标本中 AAG 的突变,并从 TCGA 和 GEO 队列中确定了它们的表达模式。我们确定了两种不同的分子亚型,并观察到 ​​AAG 突变与患者的临床病理特征、预后和浸润性 TME 相关。接下来,建立了用于预测总生存期 (OS) 的 AAG_score,并确认了其在 GC 患者中的可靠预测能力。此外,我们创建了一个高度可靠的列线图,以促进 AAG_score 的临床可行性。以微卫星不稳定性升高、突变负担和免疫激活为特征的低 AAG_score 显示出优越的 OS。此外,AAG_score 与癌症干细胞指数和药物敏感性显着相关。

结论: 总的来说,我们确定了 GC 患者的预后 AAG 特征。这一特征可能有助于阐明 TME 的特征,并有助于探索更有效的免疫治疗策略。

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