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4+TCGA生信分析:Klf9调节 mir-338-3p/nrcam 轴阻断骨肉瘤细胞的进展

生信基础 管理员 216℃ 0评论

题目:KLF9 regulates miR-338-3p/NRCAM axis to block the progression of osteosarcoma cells

杂志:J Cancer

日期:2022 年 3 月 28 日

Doi: 10.7150/jca.63533. eCollection 2022

4+TCGA生信分析:Klf9调节 mir-338-3p/nrcam 轴阻断骨肉瘤细胞的进展插图

 

背景:揭示了 MiR-338-3p 在几种癌症中充当肿瘤抑制因子。然而,尚未探索 miR-338-3p 在骨肉瘤进展中的作用。本文旨在分析miR-338-3p对骨肉瘤进展的功能影响及其潜在机制。

方法:通过蛋白质印迹或定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)评估骨肉瘤细胞中基因和miRNA的表达。通过MTT和EdU掺入测定探索骨肉瘤细胞增殖。骨肉瘤细胞迁移和侵袭能力通过伤口愈合和 transwell 试验进行了探索。采用生物信息学方法来预测靶基因。通过双荧光素酶报告基因分析验证了 miR-338-3p 与神经胶质相关细胞粘附 (NRCAM)、kruppel 样因子 9 (KLF9) 和 miR-338-3p 之间的关系。

结果:我们发现 miR-338-3p 在骨肉瘤中降低,并且 miR-338-3p 的高表达抑制了骨肉瘤细胞的增殖、侵袭和迁移能力。此外,结果表明,NRCAM的过表达可以降低miR-338-3p在骨肉瘤细胞中的抗肿瘤作用。此外,我们发现KLF9的过表达可以提高骨肉瘤细胞中miR-338-3p的表达水平。

结论: KLF9/miR-338-3p/NRCAM轴在调节骨肉瘤进展中发挥重要作用,可能成为一种很有前景的骨肉瘤治疗方法。

骨肉瘤是一种常见的高度恶性骨肿瘤,具有高转移潜能,主要发生在儿童和青少年。虽然手术治疗联合化疗显着提高了生存率,但骨肉瘤转移患者的 5 年生存率仍然很低。因此,研究骨肉瘤进展的机制并为骨肉瘤患者探索新的有效治疗靶点至关重要。

MicroRNAs (miRNAs, miRs)是内源性非编码小RNA分子(19至25个核苷酸),通过与3’UTR结合介导靶基因表达。大量研究揭示了 miRNA 在各种生物活动中的作用,包括增殖、凋亡、血管生成、侵袭以及迁移。同时,越来越多的研究报道,miR – 338-3p 的失调与癌症有关。此外,一些研究表明 TF-miRNA 轴在癌症的进展中起重要作用。例如,蔡等人。在肺大细胞神经内分泌癌中发现了一种新的 TF-miRNA-mRNA 共调控网络等人。在乳腺癌中发现了线粒体相关核心基因和 TF-miRNA-hub mrDEGs 网络。我们揭示了根据生物信息学方法,骨肉瘤中 miR-338-3p 的表达明显降低。然而,没有研究探讨 TF-miR-338-3p 对骨肉瘤进展的影响。

在本研究中,我们验证了 miR-338-3p 在骨肉瘤细胞系和组织中的表达水平下调,发现 miR-338-3p 通过直接靶向 NRCAM 抑制骨肉瘤的发展和转移。此外,我们证实了 KLF9/miR-338-3p/NRCAM 轴对骨肉瘤的增殖、侵袭和迁移具有关键作用。因此,这些结果表明 KLF9/miR-338-3p/NRCAM 轴可能作为骨肉瘤的新抗癌靶点发挥作用。

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