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6.68分TCGA生信分析:胃癌个体化免疫相关 lncRNA 对特征的综合分析

生信基础 管理员 236℃ 0评论

题目:Comprehensive Analysis of an Individualized Immune-Related lncRNA Pair Signature in Gastric Cancer

杂志:Front Cell Dev Biol

日期:2022 年 2 月 22 日

Doi: 10.3389/fcell.2022.805623. eCollection 2022

6.68分TCGA生信分析:胃癌个体化免疫相关 lncRNA 对特征的综合分析插图

 

长链非编码 RNA (lncRNA) 具有多种功能,包括免疫调节。越来越多的研究报道了免疫相关的 lncRNA 在多种癌症的预后中的作用。在这项研究中,我们开发了一个包含 13 个免疫相关 lncRNA 对 (IRLP) 的个体化特征,可以预测胃癌 (GC) 患者的总生存期、无病生存期、无进展生存期和疾病特异性生存期。癌症基因组图谱 (TCGA) 队列、内部和外部验证、特征比较和亚组分析进一步证实了其优越性、稳定性和普遍性。值得注意的是,该特征在鉴别泛癌患者的预后方面也显示出良好的适用性。然后,我们基于特征和临床因素构建并验证了总生存期的列线图,从而可以更准确地预测 GC 预后。此外,我们发现高危患者的低生存率可能是由于其具有侵袭性的临床特征、丰富的癌症相关信号通路、特定免疫抑制细胞的浸润和低肿瘤突变负担。我们进一步预测高风险组的免疫治疗反应明显更差,并确定了一些针对 GC 风险组分化的候选化合物。这种基于 IRLP 的特征可能有希望在临床实践中预测 GC 患者的生存结果和免疫治疗反应。我们发现,高危患者的低生存率可能是由于其具有侵袭性的临床特征、丰富的癌症相关信号通路、特定免疫抑制细胞的浸润和低肿瘤突变负担。我们进一步预测高风险组的免疫治疗反应明显更差,并确定了一些针对 GC 风险组分化的候选化合物。这种基于 IRLP 的特征可能有希望在临床实践中预测 GC 患者的生存结果和免疫治疗反应。我们发现,高危患者的低生存率可能是由于其具有侵袭性的临床特征、丰富的癌症相关信号通路、特定免疫抑制细胞的浸润和低肿瘤突变负担。我们进一步预测高风险组的免疫治疗反应明显更差,并确定了一些针对 GC 风险组分化的候选化合物。这种基于 IRLP 的特征可能有希望在临床实践中预测 GC 患者的生存结果和免疫治疗反应。我们进一步预测高风险组的免疫治疗反应明显更差,并确定了一些针对 GC 风险组分化的候选化合物。这种基于 IRLP 的特征可能有希望在临床实践中预测 GC 患者的生存结果和免疫治疗反应。我们进一步预测高风险组的免疫治疗反应明显更差,并确定了一些针对 GC 风险组分化的候选化合物。这种基于 IRLP 的特征可能有希望在临床实践中预测 GC 患者的生存结果和免疫治疗反应。

本研究提出了一种预测 GC 患者预后的创新特征,这可能为 lncRNA 在肿瘤免疫中的作用提供新的见解,并促进更有效的抗肿瘤免疫疗法的发展。

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