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4+TCGA生信分析:Cd24的低表达与大肠癌的存活率低有关

生信基础 管理员 238℃ 0评论

题目:Low expression of CD24 is associated with poor survival in colorectal cancer

杂志:Biochimie

日期:2022 年 1 月

Doi:10.1016/j.biochi.2021.10.004. Epub 2021 Oct 9

 

背景:CD24 是一种小 GPI 锚定的细胞表面糖蛋白,在多种恶性肿瘤中具有多种作用。最初,该蛋白被发现是肿瘤细胞上表达的 P-选择素的配体,而最近的研究表明,CD24 是许多癌症实体中的干细胞表面标志物,在肿瘤细胞中起着至关重要的作用通过与 Siglec-10的相互作用进行免疫逃避。许多作者表明,CD24 的高蛋白表达水平与乳腺癌、卵巢癌、结直肠癌和其他癌症的患者总生存期和无病生存期缩短相关。相比之下,临床和实验研究表明,CD24 低表达甚至不表达与乳腺癌 和胰腺癌的转移形成增加有关。

现有的关于 CD24 表达及其与结直肠癌临床病理特征相关性的研究是相互矛盾的:有几份报告显示,存活率低与高或低CD24 表达相关。为了解决这个科学问题,我们评估了结直肠癌患者原发性肿瘤和肝转移灶福尔马林固定组织微阵列 (TMA) 中 CD24 蛋白的表达。对顶膜染色和胞质内染色的表达进行评分,以评估 CD24 蛋白定位对患者总体存活率的作用。此外,我们进行了生物信息学分析来研究CD2的分布4 原发性结直肠肿瘤和邻近正常组织中的 mRNA 表达,以及使用来自癌症基因组图谱结肠腺癌 (TCGA-COAD) 的 RNA 测序数据检测CD24表达与患者生存的可能关联。最后,我们在人类 HT-29 结直肠癌细胞中进行了 shRNA 介导的 CD24 敲低,以研究与下调 CD24 表达相关的表型效应。

结果:原发性肿瘤顶膜和肝转移瘤细胞质中 CD24 蛋白表达降低以及总 mRNA 表达降低与结直肠癌患者的不良生存率相关。

评估了结直肠癌患者原发性肿瘤和肝转移灶的福尔马林固定组织微阵列 (TMA) 的 CD24 蛋白表达。

讨论:在这篇文章中,我们使用来自我们自己的队列的患者材料的免疫组织化学染色和来自 TCGA-COAD 的 RNA-seq 数据证明了 CD24 的低蛋白和 mRNA 表达水平与结直肠癌预后不良之间的关联。这些数据是作为多个现有报告收集的,其中包含关于 CD24 表达在结肠直肠癌中的作用的相互矛盾的信息。具体来说,一些作者证明了高 CD24 表达与缩短之间的关联。

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