生信学习,咨询,代做,请关注公众号:生信风暴。或添加客服微信:ShengxinBoss1

3+TCGA生信分析:Mirna 标志物的鉴定对肺鳞癌预后生物标志物的预测价值

生信基础 管理员 248℃ 0评论

题目:Identification of miRNA signature for predicting the prognostic biomarker of squamous cell lung carcinoma

杂志:PLoS One

日期:2022 年 3 月 15 日

Doi: 10.1371/journal.pone.0264645. eCollection 2022

3+TCGA生信分析:Mirna 标志物的鉴定对肺鳞癌预后生物标志物的预测价值插图

 

随着探索的深入,microRNAs(miRNAs)在肺鳞状细胞癌(LUSC)中的作用,从出现到转移和预后,引起了广泛关注。LUSC 相关的 miRNA 和 mRNA 样本来自癌症基因组图谱 (TCGA) 数据库。对数据进行初步筛选和预处理,利用R平台和系列分析工具识别特异性和敏感的生物标志物。发现 7 个 miRNA 和 15 个中枢基因与 LUSC 患者的总生存期密切相关。测定这些 miRNA 的表达有助于提高 LUSC 患者的总体存活率。15 个中心基因与总生存期 (OS) 相关。鉴定出新的miRNA标志物来预测LUSC的预后。

肺癌是最严重的恶性肿瘤之一,是全球癌症相关死亡的主要原因。近期统计数据显示,2020年肺癌确诊人数为221万人,死于肺癌的人数为180万人,是所有癌症类型中死亡率最高的。放射治疗和靶向治疗并不能显着提高患者的生存率,总体 5 年生存率仍低于 20%。肺癌对人类健康造成严重影响,已成为公共卫生问题。肺鳞状细胞癌(LUSC)是一种常见的肺癌组织学亚型,其特征是早期症状不典型,对放疗和化疗具有固有的抵抗力。与肺腺癌相比,缺乏合适的靶向药物导致 LUSC 的预后较差。LUSC的预后仍主要依赖于组织病理学诊断和肿瘤分期。然而,传统方法无法准确评估 LUSC 患者的预后。因此,识别预后标志物并建立新的可靠预后模型对于提高 LUSC 患者的生活质量、预后和总生存期 (OS) 至关重要。

本研究基于 TCGA 数据集确定了一个新的特征性 miRNA,并分析了 LUSC 的预后。这些分子特征通过一系列独立实验和功能实验得到验证。本研究的局限性在于结果未在临床样本中得到验证,患者数量相对较少,无法提供很好的统计能力。

对新的 miRNA 生物标志物进行鉴定以预测鳞状细胞肺癌的 OS 结果。从这项研究中获得的观察结果为建立可靠和精确的癌症治疗新方法提供了新的见解。

转载请注明:智汇基因 » 3+TCGA生信分析:Mirna 标志物的鉴定对肺鳞癌预后生物标志物的预测价值

喜欢 (0)
发表我的评论
取消评论
表情

Hi,您需要填写昵称和邮箱!

  • 昵称 (必填)
  • 邮箱 (必填)
  • 网址