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2+TCGA生信分析: 胰腺导管腺癌中潜在癌基因 fez2的鉴定

生信基础 管理员 124℃ 0评论

题目:Identification of FEZ2 as a potential oncogene in pancreatic ductal adenocarcinoma

杂志:PeerJ

日期:2022 年 1 月 5 日

Doi: 10.7717/peerj.12736. eCollection 2022

 

胰腺导管腺癌(PDAC)是常见的恶性肿瘤之一,致死率高,预后差。据报道,许多基因的失调与 PDAC 的发生和发展有关。然而,作为真核生物中高度保守的基因,Fasciculation and Elongation protein Zeta 2 (FEZ2) 在胰腺癌进展中的作用尚不清楚。在这项研究中,我们确定了 FEZ2 对 PDAC 的致癌作用。通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库的挖掘,我们发现 FEZ2 在 PDAC 组织中上调,并且 FEZ2 的表达受到其甲基化的负调控。此外,FEZ2 的高表达和低甲基化与 PDAC 患者的不良预后相关。此外,我们发现 FEZ2在体外可以促进 PDAC 细胞增殖、迁移和 5-FU 抗性。. 此外,基因通路富集分析表明,PDAC 患者中 Wnt 信号通路激活与 FEZ2 表达呈正相关。Western印迹显示FEZ2敲低显着抑制β-连环蛋白表达。总的来说,我们的发现揭示了FEZ2作为PDAC进展和迁移的潜在癌基因,FEZ2的表达对PDAC患者的治疗和化疗方案具有指导价值。

在这项研究中,我们首先探索了 FEZ 家族在许多癌症类型中的表达谱。FEZ1 和 FEZ2 在许多癌症类型中都表现出失调,但只有少数类型的癌症表现出 FEZ2 的上调,其中包括 PDAC。由于之前没有研究报道 FEZ 家族在任何类型的癌症中发挥致癌作用,这导致我们检查 FEZ2 在 PDAC 中的功能。有趣的是,抑制 FEZ2 表达会导致 PDAC 细胞增殖减少。然后我们做了更多的分析来说明FEZ2在PDAC中的作用。

在揭示了 FEZ2 的致癌作用和预后价值后,我们试图了解 FEZ2 的功能机制和调控网络。随后对FEZ2高表达患者共表达基因的基因通路富集分析显示,最显着的激活通路是Wnt信号通路,提示FEZ2可能通过激活Wnt信号通路促进PDAC细胞增殖和5-FU耐药。Western印迹显示,在PANC-1和CFPAC细胞系中,FEZ2 siRNA抑制了Wnt/β-catenin的关键蛋白表达。尽管 Wnt 信号通路参与了许多癌症进展,但其在 PDAC 中的功能以及 FEZ2 在该通路中的作用需要进一步研究。

总之,我们的数据提供了证据表明 FEZ2 通过迁移、促进细胞增殖和化疗耐药性在 PDAC 中作为致癌基因发挥作用,FEZ2 的表达和甲基化水平对 PDAC 患者具有预后价值。虽然需要进一步研究来说明 FEZ2 对 PDAC 进展的详细机制,但我们的数据为化疗方案指导和治疗靶向治疗提供了新的靶点。

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