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4+TCGA生信分析:MFAP2在胃腺癌中的分子特征及预后作用

生信基础 管理员 131℃ 0评论

题目:Pan-cancer analysis identifies BIRC5 as a prognostic biomarker

杂志:J Healthc Eng

日期:2022 年 3 月 21 日

Doi:  10.1155/2022/1417238. eCollection 2022

4+TCGA生信分析:MFAP2在胃腺癌中的分子特征及预后作用插图

 

MFAP2 的分子特征和预后作用并未说明。本研究中的 MFAP2 表达和预后价格以及 Cox 分析用于制定 MFAP2 的预测费用。要了解与 MFAP2 相关的共表达和实际网络,已使用 LinkedOmics 和 GEPIA2。MFAP2 表达已在 TCGA-STAD 肿瘤组织中的许多无偏见联盟中增加和验证。此外,在每个 TCGA 和各种队列中,MFAP2 的增加与较低的生存率有关。Cox 的评估揭示了 STAD 对平均生存期、疾病特异性生存期和无进展生存期的无偏危险过去是由于 MFAP2 的表达升高。活跃社区评估了 MFAP2,通过该 MFAP2 调节了多种与癌症相关的激酶和 E2F 家庭通路,这表明 MFAP2 影响 RNA 运输、卵母细胞减数分裂、剪接体和核糖体生物发生。MFAP2 可以独立预测并与 STAD 的预测相关联。关闭 MFAP2 与巨噬细胞标记基因的链接尤其是免疫反应的可实现核心。

胃腺癌(STAD)是消化道最常见的恶性肿瘤。尽管过去几十年对 STAD 的诊断和治疗总体有所增加,但由于缺乏早期诊断和积极治疗,STAD 的发病率和死亡率仍在增加。如果 STAD 患者被早期识别和处理,无论是通过内窥镜检查还是通过手术,五年的价格必须超过 90%。因此,STAD的实时预测大大增加了估计值。因此,有必要确定在启动和改善STAD中发挥关键作用并有助于降低死亡率和改善预测的新候选基因 。

由于应用科学在微阵列和高性能测序方面的不断创新,健康中心,特别是在科学肿瘤学领域,已经确定了更广泛的生物标志物和治疗靶点。癌症基因组图谱 (TCGA) 是一个广泛的数据库,可为大多数恶性肿瘤提供公开可用的遗传和医学证据。有了这个数据库,研究人员可以深入、准确地研究癌症的生物学和病理生理学。此外,TCGA 通过开发与大多数恶性肿瘤相关的新候选基因和科学事实来帮助预测和个性化癌症。共表达评估是构建无标度基因共表达网络的可行方法。加权基因共表达群落评估(WGCNA)已广泛用于分析高度关联基因的大规模统计单元和模块。此外,WGCNA 已被用于有效检查遗传单位和科学之间的联系,并开发适用于几种癌症、前列腺癌、食道癌和大多数宫颈癌的可行的应用生物标志物。因此,WGCNA为大多数癌症生物学提供了一种深思熟虑的解释装置,并为癌症的分子病因和预后引入了新的见解。

在STAD的增强中,MFAP2也可以起到必不可少的作用。因此,MFAP2 也可以是一个有价值的预测标志物和 STAD 中一个极好的抗癌目标。

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