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3+TCGA生信分析:SMYD5 作为肝细胞癌的潜在生物标志物

生信基础 管理员 151℃ 0评论

题目:SMYD5 acts as a potential biomarker for hepatocellular carcinoma

杂志:Exp Cell Res

日期:2022 年 5 月 15 日

Doi: 10.1016/j.yexcr.2022.113076. Epub 2022 Feb 24

3+TCGA生信分析:SMYD5 作为肝细胞癌的潜在生物标志物插图

 

由于肝细胞癌 (HCC) 的表型和分子多样性,确定患者的预后仍然是一项挑战。我们旨在评估 SMYD5 在 HCC 中的作用。Wilcoxon符号秩检验和逻辑回归分析了临床病理特征与SMYD5之间的关系。我们发现HCC中SMYD5表达增加与高组织学分级、分期、T分期和淋巴结分期密切相关。Kaplan-Meier 方法、Cox 回归、单变量分析和多变量分析检测了 TCGA-HCC 患者的总生存期。结果表明,SMYD5 的高表达预示着 HCC 的预后较差。通过 TCGA 数据集应用基因集富集分析 (GSEA),表明补体和凝血级联、脂肪酸代谢、初级胆汁酸生物合成、药物代谢细胞色素P450、PPAR信号通路和视黄醇代谢在SMYD5高表达表型中差异富集。有趣的是,我们证明了 HCC 细胞中 SMYD5 的上调是由启动子低甲基化诱导的。此外,功能实验表明,SMYD5 沉默消除了 HCC 中的细胞增殖、迁移和侵袭,并增强了紫杉醇的敏感性。所有研究结果表明 SMYD5 可能是 HCC 预后和治疗的潜在生物标志物。迁移和侵袭以及增强 HCC 中的紫杉醇敏感性。所有研究结果表明 SMYD5 可能是 HCC 预后和治疗的潜在生物标志物。迁移和侵袭以及增强 HCC 中的紫杉醇敏感性。所有研究结果表明 SMYD5 可能是 HCC 预后和治疗的潜在生物标志物。

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