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6.68分TCGA生信分析思路ISYNA1:结肠腺癌和泛癌的免疫调节相关预后生物标志物

生信基础 管理员 127℃ 0评论

题目:ISYNA1: An Immunomodulatory-Related Prognostic Biomarker in Colon Adenocarcinoma and Pan-Cancer

杂志:Front Cell Dev Biol

日期:2022 年 2 月 14 日

Doi: 10.3389/fcell.2022.792564. eCollection 2022

6.68分TCGA生信分析思路ISYNA1:结肠腺癌和泛癌的免疫调节相关预后生物标志物插图

 

背景:结肠腺癌(COAD)是世界上常见的消化系统肿瘤。然而,ISYNA1(肌醇-3-磷酸合酶 1)在 COAD 中的作用和功能仍不清楚。我们的目标是探索 ISYNA1 在泛癌中的作用,尤其是在 COAD 中。

方法:使用 TCGA(癌症基因组图谱)、GTEx(基因型-组织表达)和 CCLE(癌细胞系百科全书)评估 ISYNA1 在泛癌中的表达、临床特征和预后。ISYNA1 的通路富集分析是使用 R 包“clusterProfiler”进行的。我们使用两种免疫细胞浸润数据来源,包括TIMER在线数据库和ImmuCellAI数据库,分析了免疫细胞浸润水平与ISYNA1表达之间的相关性。

结果:与各自的正常组织相比,ISYNA1 在 COAD 和其他癌症类型中高度表达。高 ISYNA1 表达预示着 COAD 的存活率较低。我们还发现 ISYNA1 表达与 COAD 中肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤相关成纤维细胞的浸润水平呈正相关。

结论:总之,我们的研究结果表明 ISYNA1 是 COAD 中潜在的预后生物标志物。高 ISYNA1 表达表明免疫抑制微环境。

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