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3.98分生信分析:利用癌症基因组图谱 (TCGA) 数据集和荟萃分析研究长非编码 RNA CASC15 在人类实体瘤中的预后价值

生信基础 管理员 230℃ 0评论

题目:A study of the prognostic value of long non-coding RNA CASC15 in human solid tumors utilizing The Cancer Genome Atlas (TCGA) datasets and a meta-analysis

杂志:Clin Exp Med

日期:2022 年 2 月 1 日

Doi:10.1007/s10238-021-00789-7. Online ahead of print.

 

背景和目的: 据报道,一些恶性实体瘤具有长链非编码 RNA CASC15 (lncRNA CASC15) 的异常表达。然而,CASC15 在实体瘤中的临床病理学和预后重要性尚不清楚。因此,我们通过分析各种研究和与 CASC15 表达相关的癌症基因组图谱 (TCGA) 数据,检查了 CASC15、总生存期和影响人类癌症的临床病理学属性之间的相互关系。

方法: 使用Web of Science、PubMed、Cochrane Library、Embase、中文万方、中文CNKI数据库进行文献检索。采用 95% 置信区间 (CIs) 计算风险比 (HRs) 和汇总优势比 (ORs)。使用 TCGA 数据集进一步验证了当前荟萃分析的结果。

结果: 本次荟萃分析共纳入 12 项符合条件的研究,共纳入 767 名患者。分析结果显示,CASC15表达与淋巴结转移(OR = 3.30, 95%CI = 1.88-5.81, p < 0.001)、远处转移(OR = 2.64, 95%CI = 1.24-5.63)有显着相关性, p = 0.012) 和高 TNM/临床阶段 (OR = 2.67, 95%CI = 1.34-5.32, p = 0.005)。此外,我们发现 CASC15 表达升高可预测总生存期 (OS) 的不良结果 (HR = 2.01, 95%CI = 1.71-2.36, p < 0.001)。对 TCGA 数据集的进一步调查显示,CASC15 在许多癌症中都有异常表达,这至少部分验证了当前荟萃分析的结果。

结论: 根据最新的荟萃分析和系统评价,CASC15高表达与实体瘤患者较差的生存结局相关,CASC15作为实体瘤预后预测因子具有坚实的理论基础。

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