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5+TCGA生信分析文章:子宫内膜异位症相关卵巢癌的 TCGA 分子分型

生信基础 管理员 177℃ 0评论

题目:TCGA molecular classification in endometriosis-associated ovarian carcinomas: Novel data on clear cell carcinoma

杂志:Gynecol Oncol

日期:2022 Mar 31

Doi:10.1016/j.ygyno.2022.03.016.

5+TCGA生信分析文章:子宫内膜异位症相关卵巢癌的 TCGA 分子分型插图

背景: 透明细胞癌和子宫内膜样卵巢癌(分别为 OCC 和 OEC)推测起源于子宫内膜异位症,并且彼此之间以及与其子宫内膜对应物共享分子改变。基于癌症基因组图谱 (TCGA) 的分子分类将子宫内膜癌分为四类:POLE 突变 (POLEmut)、错配修复缺陷 (MMRd)、p53 异常 (p53abn) 和具有不同预后的无特异性分子谱 (NSMP)。随后的研究表明,这种TCGA分类在OEC中具有一定的价值,但与OCC相关的知识有限。

方法: 在大量 OCC(n = 115)和 OEC(n = 158)中评估和比较子宫内膜癌的分子分类。对错配修复和 p53 蛋白进行 POLE 突变分析和基于组织微阵列的免疫组织化学。

结果: 在OCCs/OECs中分子组分布如下:POLEmut 0.9%/3.2%、MMRd 3.5%/6.3%、p53abn 20%/30%和NSMP 76%/60%。NSMP 肿瘤的比例在两种组织学类型中都是最大的,并且在 OCC 中显着高于 OEC (p = 0.009)。分子分类与 OCC 和 OEC 中的 DSS 显着相关(分别为 p < 0.001 和 p = 0.009),并且与 OCC 中的 DFS 显着相关(p = 0.001)。POLEmut 和 MMRd OCC 预后良好,而 MMRd OEC 预后较差。p53abn 组与两种肿瘤类型的预后最差相关,特别是在 OCC 中强调。

结论: TCGA 分子分类与两种组织型的患者预后相关,并且在 OCC 中分子组之间的预后差异更为显着。大量 NSMP 肿瘤凸显了进一步研究的必要性。

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